Как учитывать домашнюю работу и утренние упражнени...

Думаю, это не сильно считается. Думаю затрат калорий мимический, а если неправильно рассчитать, есть риск, что коридор нормы рациона сдвинется в большую сторону.
Я бы в данном случае не записывала активность, для чуть большего дефицита. Хотя бы с учетом, что все равно при составлении меню и если продукты из базы - небольшие погрешности будут.

домашние дела уже учтены при расчетах в группе труда, а утренняя зарядка не тратит существенно ккал, чтобы их заносить как тренировку